1986年毕业于西北电讯工程学院技术物理系，获工学学士学位。
1986年至1993年在华中理工大学光电子工程系学习，先后获光学专业理学硕士和物理电子学与光电子学专业工学博士学位。
1993年11月起在华中科技大学工作。1993年至1999年任光电子工程系讲师、副教授、教授，其间1995年至1997年美国宾夕法尼亚大学医学院生物化学与生物物理学系博士后副研究员。
1997年2月创建生物医学光子学研究中心。2000年8月起任生物医学光子学教育部重点实验室主任。
1999年年1月至2007年9月任生命科学与技术学院副院长、院长，其间1999年1月至2004年3月兼任生物医学工程系主任。
2007年3月任武汉光电国家实验室(筹)常务副主任，2007年7月至2012年6月兼任光电子科学与工程学院院长。
2006年1月当选华中科技大学党委委员。
2007年8月任华中科技大学副校长。
2011年5月任华中科技大学党委常委、副校长。
骆清铭是国家自然科学基金“生物医学光子学”创新研究群体负责人，国家创新人才推进计划重点领域创新团队负责人，国家重大科学研究计划项目首席科学家，国家重大科学仪器设备开发专项项目负责人。1999年受聘教育部长江学者奖励计划特聘教授(首批)，2000年荣获国家杰出青年科学基金，2007年当选国际光学工程学会会士(SPIE Fellow)；2012年当选英国工程技术学会会士（IET Fellow）；2014年当选美国光学学会会士（OSA Fellow）；2016年当选美国医学与生物工程院会士（AIMBE Fellow）。
