学习经历 2002.10-2006.7，浙江大学生命科学学院，生物科学，学士 2006.9-2011.6，中国科学院微生物研究所，生物化学与分子生物学，博士 工作经历 2011.7-2013.2，中国科学院微生物研究所病原室，助理研究员 2013.3-2013.7，中国科学院北京生命科学研究院科研部，助理研究员 2013.8-2016.2，中国科学院北京生命科学研究院科研部，副研究员 2015.10至今，中国科学院大学存济医学院，岗位教授 2016.3至今，中国科学院微生物研究所，研究员 研究组研究方向： 　　主要从事病原感染调控的分子机制和免疫细胞受体与配体相互作用机制的研究，同时基于结构进行抗感染药物的研发。 研究组研究内容及意义： 　　1.病原感染调控的分子机制 　　病原微生物跨宿主间传播是一个相当复杂的过程，诸多因素参与控制和调节。利用病原学、免疫学和结构生物学等手段，靶向病原微生物进入宿主细胞内部后的科学问题，如病原微生物如何在细胞内部复制和组装，以及宿主因子如何调控病原感染。通过这些研究，能够了解病原在细胞内部的感染过程，并在此基础上进一步研发抗病毒手段。 　　2.抗病原感染的分子机制 　　开展研究天然免疫受体与其配体，细胞因子与其受体的相互作用,以及天然免疫感受器识别病原来源核酸的分子机制；开展病原感染时的免疫细胞库研究（包括T和B细胞），推动细胞免疫治疗、疫苗和抗体等相关工作的进行。

获奖情况 2014年，荣获中国科学院“卢嘉锡青年人才奖” 2014年，荣获中国科学院卓越青年科学家项目资助 2015年，入选中国科学院青年创新促进会会员 2016年，荣获国家自然科学基金委“优秀青年科学基金项目”资助 2016年，荣获首届“中源协和生命医学创新突破奖” 2016年，荣获中国生命科学领域十大进展奖 2017年，所参与完成的“禽流感病毒感染人的生态与分子机制研究”项目荣获2017年中华预防医学会科学技术奖一等奖 学术兼职 中国免疫学学会青年工作委员会委员 中国微生物学会病毒学专业委员会青年委员会委员 北京免疫学会常务理事 中国研究型医院学会空间微生物学与感染专业委员会常务委员 中国研究型医院学会空间微生物学与感染专业委员会青年委员会副主任委员 北京生物化学与分子生物学会第二届青年委员会委员 代表性论文 Shi* Y, Gao* GF. 2017. Structural biology of the Zika virus. Trends in Biochemical Sciences, 42(6): 443–456 Yuan Y#, Cao D#, Zhang Y#, Ma J#, Qi J, Wang Q, Lu G, Wu Y, Yan J, Shi* Y, Zhang*X, Gao* GF. 2017. Cryo-EM structures of MERS-CoV and SARS-CoV spike glycoproteins reveal the dynamic receptor binding domains. Nature Communications. 8:15092. Duan W#, Song H#, Wang H, Chai Y, Su C, Qi J, Shi* Y, Gao* GF. 2017. The crystal structure of Zika virus NS5 reveals conserved drug targets. The EMBO Journal 36: 919–933. Shi Y, Ai Kawana-Tachikawa, Gao F, Qi J, Liu C, Gao J, Cheng H, Ueno T, Iwamoto A, Gao* GF. 2017. Conserved Vδ1 Binding Geometry in a Setting of Locus-Disparate pHLA Recognition by δ/αβ T Cell Receptors (TCRs): Insight into Recognition of HIV Peptides by TCRs. Journal of Virology. 91(17): e00725-17. Han X, Qi J, Song H, Wang Q, Zhang Y, Wu Y, Lu G, Kwok-Yung Yuen, Shi* Y, Gao* GF. 2017. Structure of the S1 subunit C-terminal domain from bat-derived coronavirus HKU5 spike protein. Virology. 507:101-109. 　　Wang H#, Shi Y#, Song J#, Qi J#, Lu G, Yan J, Gao* GF. 2016. Ebola viral glycoprotein bound to its endosomal receptor Niemann-Pick C1. Cell 164(1-2):258-68. 　　Shi* Y, Wu Y, Zhang W, Qi J, Gao* GF. 2014. Enabling the 'host jump': structural determinants of receptor-binding specificity in influenza A viruses. Nature Reviews Microbiology 12:822-31. 　　Sun X#, Fujiwara M#, Shi Y#, Kuse N, Gatanaga H, Appay V, Gao GF, Oka S, Takiguchi* M. 2014. Superimposed epitopes restricted by the same HLA molecule drive distinct HIV-specific CD8+ T cell repertoires. Journal of Immunology 193(1):77-84. 　　Shi Y#, Zhang W#, Wang F#, Qi J#, Wu Y#, Song H, Gao F, Bi Y, Zhang Y, Fan Z, Qin C, Sun H, Liu J, Haywood J, Liu W, Gong W, Wang D, Shu Y, Wang Y, Yan J, Gao* GF. 2013. Structures and Receptor Binding of Hemagglutinins from Human-Infecting H7N9 Influenza Viruses. Science 342:243-247 　　Zhang W#, Shi Y#, Lu X, Shu Y, Qi J, Gao* GF. 2013. An airborne transmissible avian influenza H5 hemagglutinin seen at the atomic level. Science 340:1463-1467. 　　Liu D, Shi W, Shi Y, Wang D, Xiao H, Li W, Bi Y, Wu Y, Li X, Yan J, Liu W, Zhao G, Yang W, Wang Y, Ma J, Shu* Y, Lei* F, Gao* GF. 2013. Origin and diversity of novel avian influenza A H7N9 viruses causing human infection: phylogenetic, structural, and coalescent analyses. Lancet 381:1926-1932. 　　Sun X#, Shi Y#, Lu X, He J, Gao F, Yan J, Qi J, Gao* GF. 2013. Bat-derived influenza hemagglutinin H17 does not bind canonical avian or human receptors and most likely uses a unique entry mechanism. Cell Reports 3:769-778. 　　Zhang W#, Shi Y#, Qi J, Gao F, Li Q, Fan Z, Yan J, Gao* GF. 2013. Molecular basis of the receptor binding specificity switch of the hemagglutinins from both the 1918 and 2009 pandemic influenza A viruses by a D225G substitution. Journal of Virology 87:5949-5958. 　　Shi Y, Qi J, Iwamoto A, Gao* GF. 2011. Plasticity of human CD8alphaalpha binding to peptide-HLA-A*2402. Molecular Immunology, 48(15-16): 2198-2202.