本发明提供了一种基于图像融合的指纹识别系统,包括指纹采集模块、数模转换模块、指纹图像处理模块、指纹数据库模块和结果验证模块,所述指纹采集模块用于采集目标指纹的红外图像与紫外图像;所述数模转换模块用于对目标指纹的红外图像与紫外图像分别进行数模转换;所述指纹图像处理模块用于对目标指纹的红外图像与紫外图像进行去噪、分解和合成处理,得到目标指纹图像;所述指纹数据库模块中存储有标准的指纹图像;所述结果验证模块将目标指纹图像与标准的指纹图像进行对比验证,得到指纹验证结果,并对结果进行显示。本发明将目标指纹的红外图像与紫外图像进行融合,利用融合后的指纹图像来进行指纹识别,提高指纹识别的精确度。