本发明涉及河道湖泊底泥治理技术领域，是一种原位改良上述黑臭水体底泥的方法，具体为向底泥中依次投放沸石粉、过氧化钙、高效聚合氯化铝、天然矿物质复合材料、改性硅藻土与改性凹凸棒土，一边投加一边进行搅拌，在1小时～2小时完成投放；物料投放完成后，持续搅拌20～40分钟；向底泥中投加活化后的反硝化菌剂、光合细菌剂与枯草芽孢杆菌剂，并进行底部曝气1～4小时；3～7天后，种植沉水植物。它简单易行，施工时间短，生态效果良好；在对底泥污染物原位去除的同时恢复上覆水体水域环境，短时消除水体黑臭，增加水体透明度，固化消除底泥中污染物质，降低上覆水体中COD、氨氮和总磷含量，较短时间内恢复水生态环境。
