本发明提供了一种钢结构防腐复合涂层的施工工艺,包括表面净化处理、喷砂除锈、电弧喷锌铝复合层和封闭处理。其中的电弧喷锌铝复合层是采用电弧喷枪,以电弧为热源,先将纯度≥99.5%的线状锌丝加热到熔融状态,同时用压缩空气将熔融的锌吹成雾状,并形成受约束的颗粒流,均匀喷涂在基体表面形成一层锌层,再将纯度≥99.5%的线状铝丝加热到熔融状态,同时用压缩空气将熔融的铝吹成雾状,并形成受约束的颗粒流,均匀喷涂在锌层表面形成一层铝层,铝层与锌层一起组成锌铝复合层。采用本发明的钢结构防腐复合涂层的施工工艺,其防腐涂层与钢结构基体的结合力强,平均达到12.0MPa,大大高于国家标准,能达到长效防腐的目的而且改善了结构的外观。