本发明公开了一种环境变量时空分布的综合分析方法，首先计算各时空滞后距上的试验变异函数值，并拟合理论变异函数模型；然后联合时空样点数据，进行时空克里格插值，估算未测时空位置的地理属性值；并建立环境变量值与区域位置的定量关系，形成环境变量值时空分布的趋势体，得到基于时空趋势克里格预测结果；提出多种时空不确定性评估方法；最后直观地对环境变量的时空分布状况进行评价。本发明充分考虑了环境变量时空结构性和连续性的特点，从建模、预测、趋势分析、不确定性分析、时空分析多个角度对环境变量时空分布特点进行了充分的模拟和分析，为区域环境评估和相关部门进行时空决策及辅助分析提供了方法依据。
