本发明公开了一种干细胞复合外泌体的制备方法,具体为脐带间充质干细胞与宫内膜干细胞复合外泌体的制备方法,包括如下步骤:S1、脐带间充质干细胞外泌体的制备;S2、宫内膜干细胞外泌体的制备;S3、脐带间充质干细胞与宫内膜干细胞复合外泌体的制备:将脐带间充质干细胞外泌体和宫内膜干细胞外泌体混合,加入保护剂,低温冷冻干燥处理,得到干细胞外泌体冻干粉。本发明方法制备的脐带间充质干细胞与子宫内膜干细胞外泌体复合生长因子对于解决女性生殖健康问题,具有无痛苦,不开刀,不手术,无副作用,结合医院检测,在家便可使用,安全高效。