本发明公开了一种基于多卫星链路的新型集群通信系统及其通信方法,系统包括卫星转接设备、终端、卫星、指挥调度中心,所述卫星转接设备支持接收终端数据,并通过卫星转发至指挥调度中心,所述卫星转接设备同时支持接收卫星数据,并转发至终端。卫星数据通过两种方式传输至指挥调度中心,一是通过卫星信关站进行转发,发送至指挥调度中心的通信服务器,二是在指挥调度中心建立卫星通信设备,接收不同卫星发送过来的数据,发送至通信服务器。本发明解决了边远地区因通讯网络限制无法对终端进行管理及数据通信的问题,可实现终端与指挥调度中心数据的双向传输和交互,以实现对边远地区终端进行纵向指挥调度管理功能。