本实用新型公开了一种深水清淤作业系统,包括深水清淤车、淤泥浓缩母船和岸基固化处理站,淤泥浓缩母船与深水清淤车电气连接,且深水清淤车通过长程输送管道将收集的淤泥输送到淤泥浓缩母船,淤泥浓缩母船将浓缩脱水后的淤泥通过一高浓淤泥输送管路输送到岸基固化处理站。本实用新型通过水下作业车收集‑水下输送‑水面处理的施工方式,能够满足不同水深下的清淤需求,最深可达200~300m水深,且可适应不同地形,不同淤泥类别的淤泥进行高效率清理及处理,具有作业深度大、机动性强、清淤率高、覆盖范围广、扰动小和处理能力强等特点,满足环保节能的需求。