本发明提供一种氢燃料电池物流车能源辅助结构及其控制方法,能源辅助结构包括制动空气压缩电机控制器、制动空气压缩电机和储气罐,制动空气压缩电机控制器电性连接制动空气压缩电机,制动空气压缩电机控制器包括控制板和功率板,控制板与功率板采用插针的方式连接,功率板上设有IGBT功率元件,IGBT功率元件与制动空气压缩电机之间采用柔性铜排连接,制动空气压缩电机连接储气罐,储气罐上设有多通阀和机械泄压阀,多通阀连接气刹系统。本发明的有益效果:本发明通过制动空气压缩电机将氢燃料电池物流车的怠速输出功率进行吸收和消耗,使得氢燃料电池物流车的能量管理系统控制更为简单合理,并进一步提高了整车制动的稳定性和可靠性。