本发明涉及一种甲醇水蒸气重整与氢分离一体式高压制氢系统，包括重整分离装置、三相换热装置、疏水器、水冷换热器、二氧化碳分离装置以及水煤气重整装置；所述液态泵的泵压为18～50MPa。一种甲醇水高压制氢方法，液态泵将甲醇水送入甲醇水蒸汽管进管，泵压为18～50MPa，将二氧化碳混合余气送入二氧化碳分离装置内进行二氧化碳液化分离；将氢气混合余气送入水煤气重整装置内重整，重整混合气随氢气、二氧化碳和一氧化碳的混合气体再次送入反应腔内进行分离氢气作业；实现对系统内的气体进行循环纯化，理论收率可达到100％，实现氢气收率≥95％。
