本实用新型公开了一种用于缓流黑臭水体治理的微生物立体修复装置,包括固定在水体底部的主体支架,固定在主体支架上的超细纤维立体填料,超细纤维立体填料包括一端固定在主体支架上的中心绳及固定在中心绳上附着有微生物菌种的超细纤维丝;所述中心绳的上方连接设置有使超细纤维立体填料直立在水中的浮球;还设置有曝气装置,所述曝气装置包括鼓风机和微孔纳米曝气管及输气管。本实用新型事先将微生物固定在超细纤维立体填料上,超细纤维立体填料巨大的比表面积能为微生物提供充足的生存空间,有利于微生物的负载增殖,微孔纳米曝气系统提供足够的空气,能有效促进好氧微生物快速适应和驯化,加快水体中污染物的降解,提高黑臭水体治理效率。