本发明涉及一种制备低砷无氟南极磷虾油的方法，包括：a）将南极磷虾切碎或碾磨成磷虾碎块；b）将磷虾碎块预热；c）将磷虾碎块加热达到100‑200℃的温度，以高温提取切碎或碾磨的磷虾碎块中的粘性磷脂；d）从磷虾碎块蒸煮液中分离部分脱脂固体和固液混合物；e）挤压部分脱脂固体物得到压制液；f）从压制液中分离残余固体颗粒以得到无残留固体颗粒的压制液；g）向压制液中加入水，用HCl调节至pH4‑6，酸洗相分离得到水相和油相，保留油相，得到乳液；h）除去乳液中的水，以获得富含磷脂的磷虾油。本发明可保证使用高度新鲜，切碎或分级的磷虾，避免磷脂分解和/或脂质变质。另外，制备得到的磷虾油砷量大大降低。
